Pirmā publikācija – dzejolis "Mēnessērdzīga dziesmiņa" ("Literatūra un Māksla", 1976, 3. jūlijā).
Dzeja
Dzeja publicēta periodikā, jauno autoru dzejas krājumā "Acis" (1981), izdota autorizdevumos nelielos metienos.
2001: Ķīnas pārlidojumi.
2002: Turcijas cikls.
2005:
Pago Pago: 1995–2005.
2006: Trauslā viela (izdots Viļņā).
Darbu tulkojumi citās valodās
Bonifacijus Daukštas. Knyga “Trapioji materija”, Vilnius, 2006. (“Trauslā viela” lietuviešu valodā, atdzejojusi Dzintra Elgas Irbyte.)
Atdzejojumi
1984: atdzejojis no krievu valodas dzejoļus un poēmas Mihaila Ļermontova Kopotu rakstu 1. un 2. sējumā (Liesma).1984:: atdzejojis no ukraiņu valodas latviski ukraiņu dzejnieku darbus izlasē "Iet bērni pa Kijevu” (Liesma).
Atdzejojis latviski arī Vladimira Nabokova un Sergeja Jeseņina darbus.
Emuāra bonis.lv kategorijā "Dzeja" lasāma Bonifācija Daukšta dzeja un atdzeja.
Citi darbi
2012: Kopveža Voldemāra Ozola kara gaitas un politiskā evolūcija (LU Akadēmiskais apgāds).
2012: Kulturālās tuvināšanās biedrība ar SPRS tautām (1929–1940) (LU akadēmiskais apgāds).
Darbojies arī kā redaktors un grāmatu sērijas “Mazās vēstures bibliotēkas” redkolēģijas loceklis.